Kurikulum progdi Agroteknologi UMK telah dirancang berdasarkan relevansi dengan tujuan, cakupan dan kedalaman materi, pengorganisasian yang mendorong terbentuknya hard skills dan keterampilan kepribadian dan perilaku (soft skills) yangdapat diterapkan dalam berbagai situasi dan kondisi.

Sejak tahun 2010 sampai dengan 2017, kurikulum yang diterapkan di Progdi Agroteknologi UMK adalah Kurikulum Berbasis Kompetensi (KBK) yang disusun berdasarkan Kepmendiknas No 232/U/2000 dan Kepmendiknas No 045/U/2002. KBK mengutamakan tercapaianya kompetensi sebagai wujud usaha untuk mendekatkan pendidikan pada kondisi pasar kerja dan industri. Impelemntasi KBK ini memerlukan penetapan kompetensi utama yang ditetapkan progdi sejenis dan pengguna lulusan serta kompetensi pendukung dan kompetensi lain yang ditetapkan oleh perguruan tinggi sendiri.

Pada tahun 2017, Progdi Agroteknologi UMK melakukan pengembangan kurikulum dari KBK menjadi KPT, dengan tujuan utama untuk lebih meningkatkan kualitas lulusan dan menjamin agar lulusan Progdi Agroteknologi UMK memiliki kualitas yang setara dengan kualifikasi yang disepakati dalam KKNI (Peraturan Presiden No. 08 Tahun 2012). KPT diberlakukan sejak tahun akademik 2018/2019.